یکی دیگر از مقاطع پرطرفدار تحصیلی جهت اخذ اقامت تحصیلی در کشور ترکیه مقاطع تحصیلات تکمیلی است. برای تحصیل در مقطع کارشناسی ارشد و یا دکتری در دانشگاه های ترکیه ابتدا باید رشته مورد نظر را انتخاب کرد و پس از بررسی مدارک مورد نیاز طریق سایت دانشگاه و یا دانشکده برای ثبت نام اقدام کرد. مدارکی که برای ثبت نام در مقاطع تحصیلات تکمیلی دانشگاه های کشور ترکیه مورد نیاز است به طور کلی شامل فرم درخواست پذیرش، مدارک تحصیلی بصورت ترجمه شده، انگیزه نامه، توصیه نامه معتبر، برخی نمرات آزمونی نظیر GRE و یا GMAT، ترجمه پاسپورت و عکس پرسنلی مورد نیاز است. تحصیل در مقاطع تحصیلات تکمیلی به دلایل بسیار زیادی از جمله کیفیت بالای آموزشی، امکانات بالای تحقیقاتی و آزمایشگاهی، امکان شرکت در برتربن کنگره های بین المللی و حتی امکان ادامه تحصیل در دانشگاه های برتر اروپایی و آمریکایی مورد استقبال بسیاری از دانشجویان ایرانی قرار گرفته است.
ذکر این نکته نیز خالی از لطف نیست که بسیاری از دانشگاه های ترکیه در ابتدای تحصیل مدرک زبان نمی خواهند و به دانشجو این فرصت را می دهند تا با شرکت در دوره های زبان انگلیسی و یا ترکی، مهارت زبان خود را تقویت کرده و سپس در آزمون های زبان شرکت نمایند. حتی برخی از دانشگاه ها آزمون زبان مختص به خود را دارند که با مراجعه به وب سایت دانشگاه می توان از شرایط این آزمون ها کسب اطلاع کرد.
در پایان می توان به این نکته اشاره داشت که بسیاری از دانشگاه ها در کشور ترکیه وجود دارند که به لحاظ علمی دارای رتبه های بالاییی در سیستم های ارزیابی استانداردهای آموزشی هستند و توانسته اند در زمره برترین دانشگاه های دنیا قرار گیرند. از جمله این دانشگاه ها می توان به دانشگاه های کوچ، سابانجی، خاورمیانه، بیلکنت، بغازیچی، استانبول، آنکارا، حاجت تپه، اگه و قاضی اشاره داشت.